为加强学科建设，北京大学自2007年将对环境学院现有行政管理体制进行调整，调整后分别成立“城市与环境学院”和“环境科学与工程学院”两个独立建制学院。

　　环境科学与工程学院设置环境科学、环境工程2个本科专业，负责北京大学环境科学与工程本科人才基地的建设。城市与环境学院设置地理科学、资源环境与城乡规划管理、城市规划、生态学、环境科学等5个本科专业，负责北京大学国家理科地理学人才基地的建设。 

　　2007年环境类本科生仍以环境学院进行招生。新生在第一年执行基本统一的教学计划，在第二学年学生将在双向选择的基础上，分别进入环境科学与工程学院和城市与环境学院，选择进入环境科学、环境工程、地理科学、资源环境与城乡规划管理、城市规划（5年制工科）和生态学等专业继续学习。

　　北京大学是我国最早开展环境学科教育和科学研究的机构之一。北京大学环境学院于2002年6月在原城市与环境学系、环境科学中心以及技术物理系环境化学专业的基础上组建。环境学院设5个系，即环境科学系、环境工程系、资源与环境地理系、城市与区域规划系、生态学系，学院还下设历史地理研究所，并拥有“环境模拟与污染控制”国家重点联合实验室，以及地表过程分析与模拟和水沙科学2个教育部重点实验室。